Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2P04141 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2P04141 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2P04141 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms