Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms