Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms