Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCC2H7BZ55 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROCC2H7BZ55 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms