Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-1B6SEH8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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