Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CFAP73A6NFT4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CFAP73A6NFT4 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CFAP73A6NFT4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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