Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPACA6W5XKT8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms