Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP3K4Q9Y6R4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms