Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms