Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAN1Q9Y2M0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms