Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms