Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms