Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSEQ9UL01 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms