Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms