Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABCF2Q9UG63 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABCF2Q9UG63 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABCF2Q9UG63 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABCF2Q9UG63 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABCF2Q9UG63 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ABCF2Q9UG63 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABCF2Q9UG63 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABCF2Q9UG63 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABCF2Q9UG63 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABCF2Q9UG63 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABCF2Q9UG63 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABCF2Q9UG63 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms