Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms