Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms