Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPG2Q9UBF2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms