Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIT1Q9P2V4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIT1Q9P2V4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIT1Q9P2V4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIT1Q9P2V4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIT1Q9P2V4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIT1Q9P2V4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIT1Q9P2V4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIT1Q9P2V4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIT1Q9P2V4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIT1Q9P2V4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIT1Q9P2V4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIT1Q9P2V4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIT1Q9P2V4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIT1Q9P2V4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms