Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms