Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MBD5Q9P267 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms