Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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