Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms