Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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