Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms