Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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