Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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