Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms