Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms