Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCMBPQ9BTE3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms