Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms