Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBPQ99417 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms