Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNL2Q96S94 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms