Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL7Q96S82 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms