Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms