Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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