Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms