Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms