Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms