Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms