Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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COPS9Q8WXC6 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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COPS9Q8WXC6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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