Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCER1Q8TC90 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER1Q8TC90 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms