Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RNF148Q8N7C7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RNF148Q8N7C7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RNF148Q8N7C7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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RNF148Q8N7C7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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