Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CLDN19Q8N6F1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CLDN19Q8N6F1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CLDN19Q8N6F1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CLDN19Q8N6F1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CLDN19Q8N6F1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CLDN19Q8N6F1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CLDN19Q8N6F1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CLDN19Q8N6F1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CLDN19Q8N6F1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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