Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTROBQ8N137 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms