Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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C9orf40Q8IXQ3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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C9orf40Q8IXQ3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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C9orf40Q8IXQ3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C9orf40Q8IXQ3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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