Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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