Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBRM1Q86U86 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms