Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms