Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP31Q70CQ4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
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